一、由监狱管理机关执行。当公民因犯罪被判处剥夺政治权利的处罚时，监狱管理机关将在主刑执行期间对其实施这一处罚。例如，当犯罪分子被判处有期徒刑、无期徒刑或死刑缓期二年执行时，在判决生效之后，罪犯将被送往监狱进行改造教育。在此期间，监狱管理机关将依照刑法规定对其执行剥夺政治权利。如果罪犯在主刑尚未执行之前，其剥夺政治权利的判决已经执行完毕，那么这种处罚对罪犯的惩罚、教育和警戒作用将无法得到体现。

二、由公安机关执行。对于那些被判处管制拘役的罪犯，公安机关负责执行其主刑和附加的剥夺政治权利。根据刑法规定，附加剥夺政治权利的期限将从主刑执行完毕或者假释之日起开始执行。刑事诉讼法明确规定，对于那些被判处剥夺政治权利的罪犯，应由公安机关负责执行这一附加刑罚。当罪犯从监狱中释放或者假释时，监狱应当在相关证明文件中注明其被剥夺政治权利的起始和结束时间，并将其转交给居住地的公安机关。公安机关应当在罪犯居住地进行公告，并在其执行完毕后宣布恢复其政治权利。这样确保了公民的政治权利得到合法保护，同时也对犯罪人员进行了应有的惩处和教育。