一、公司设立的方式

1. 发起设立：由发起人认购公司应发行的全部股份，以此设立公司。这种方式表明公司的成立完全依赖于发起人的资金支持。

2. 募集设立：这是由发起人认购公司应发行股份的一部分，其余股份则通过公开募集或特定对象募集的方式设立公司。这种方式可以吸引更多的投资者参与。根据《公司法》第七十七条，股份有限公司可以采取这两种方式之一进行设立。

二、公司设立协议与公司章程的差异

1. 在我国，由于公司组织形式的不同，法律对于设立协议和公司章程的规定也有所不同。对于股份有限公司和有限责任公司，公司法在设立协议方面存在差异，对有限责任公司的国家干预较少，而对股份有限公司的国家干预则较多。无论何种公司，公司章程都是其成立的必备文件。

2. 性质差异：设立协议通常是一种不要式的法律文件，主要根据当事人的意思表示形成。而公司章程则是要式的法律文件，其内容必须严格遵循公司法的规定。

3. 效力差异：设立协议主要在发起人之间具有法律约束力，调整的是发起人之间的权利义务关系。而公司章程则约束所有股东、股东与公司之间、公司的管理机构与公司之间的关系。从效力的时间来看，设立协议的效力只存在于公司设立过程，而公司章程的效力则贯穿公司成立及其存续期间，直至公司完全终止。

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