不论是在现有的法律环境还是未来法律修订后，深入理解公司章程的性质并确保其功能的全面发挥，都是保护小股东权益的重要途径。公司章程，作为企业的基本法则，详细规定了公司的组织结构、运营方式以及成员间的权利义务关系。

对于改制企业而言，由于其特殊的背景和企业结构的转变，小股东的权益保护尤为重要。大多数改制后的企业，特别是中小型国有企业和城镇集体企业，多采用有限责任公司的形式。从公司章程的角度来探讨小股东权益的保护具有更为实际的意义。

现行的《公司法》对于公司章程的内容规定相对简洁，加之改制过程中的时间紧迫，很多企业在设立新公司时并未对章程的制定和完善给予足够的重视。这导致在实际操作中，一旦股东间出现纠纷，或董事、经理出现侵害公司财产的行为，中小股东的权益很难得到保障。

为了更有效地保护中小股东的合法权益，在制定和完善公司章程时，可以从以下几个方面进行考虑：

1. 在符合《公司法》强制性规定的前提下，可以在章程中设定更为严格的规定，以约束大股东的行为。例如，对于决策权的行使，可以设定更高的门槛，以防止大股东滥用权力。

2. 对《公司法》中较为简单或不完善的规定，如股东的权利和义务等，进行细化并增强可操作性。特别是要强调大股东和董事对公司、对中小股东的忠诚责任和管理义务。

3. 明确公司的监督体系和方式，特别是要强化监事会的职能，并限制大股东在监事会中的比例，确保一定比例的小股东代表进入监事会。

4. 引入财务、政务公开制度。借鉴国家机关和村级组织的成功经验，让公司的权力在阳光下运行。

5. 赋予股东更多的知情权、调查权。除了《公司法》规定的查阅股东会记录和公司财务会计报告外，可以在章程中进一步细化。

6. 对于董事、经理违反《公司法》规定的行为，可以在章程中设定具体的处罚措施。这样可以在问题出现时及时作出反应，防止损失扩大。

通过完善公司章程，我们可以为改制企业的小股东们打造一个更加公平、透明的经营环境，确保他们的权益得到全面、有效的保护。