当员工遭遇工作事故或被诊断为职业病时，其所在的公司需遵循一定的程序进行工伤认定申请。接下来，我们将为您详细介绍相关内容。

一、持有公司借款借条能否申请工伤认定？

答案是肯定的。根据相关规定，员工所在的公司必须在事故发生后的一个月内提交工伤认定申请，而受伤的员工则有一年的全权负责期限。这意味着无论是因工作事故还是按职业病防治法被诊断为职业病，公司都应及时向社会保险行政部门提出工伤认定申请。

根据《工伤保险条例》第十七条的规定，当员工发生事故伤害或被诊断、鉴定为职业病时，其所在单位应在事故发生日或被诊断、鉴定为职业病之日起的30日内，向所在统筹地区的社会保险行政部门提交工伤认定申请。若存在特殊情况，经社会保险行政部门同意，申请时限可适当延长。

如果公司未按时提出工伤认定申请，工伤职工或其近亲属、工会组织可以在事故伤害发生日或被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，直接向所在单位所在地的统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。

二、工伤认定期间可以辞职吗？

员工在工伤认定期间确实有权利选择辞职。如果您在收到劳动能力鉴定结论通知书前决定离职，这是您的合法权利。若您选择在收到工伤认定书及劳动能力鉴定结论通知书后，向用人单位索取应支付的工伤待遇时辞职，这将为接下来的伤残鉴定及赔偿事务带来更大的便利。

但是请注意，若在享受工伤认定权益期间主动提出辞职，可能会对接下来的伤残鉴定及相应的赔偿事务产生一定的影响。我们建议您在工伤认定期间尽可能保持原有的工作状态，避免在此阶段进行离职操作。若您确实需要离职，请确保您已经完成了所有的工伤认定及赔偿事宜。

以上内容仅供参考，如有更多疑问或需要更详细的解释，请咨询专业律师或相关机构。