关于单位犯罪的处罚方式，刑法理论中存在单罚制与双罚制两种主要观点。单罚制是指只针对单位中的个人或者单位本身进行处罚，而双罚制则同时对单位和单位中的个人进行处罚。

回顾我国的刑法历程，最初在1979年的刑法中，我们采用的是单罚制的方式。例如，刑法第127条针对违反商标管理法规的行为进行了规定，但当时并未明确承认单位犯罪。到了1987年，《海关法》首次明确规定了单位犯罪，并确立了双罚制原则。在此之后，我国的刑事立法大多数都对单位犯罪采取了双罚制原则。

相较于单罚制，双罚制更加科学、合理。这是因为单位作为一个整体组织，应当对其意志支配下的犯罪行为承担刑事责任。但同时也要认识到，单位是由个人组成的，因此当单位的直接负责主管和直接责任人员实施犯罪行为时，他们个人也应当对单位的犯罪行为承担刑事责任。对于单位犯罪，既要处罚单位本身，也要处罚相关的个人。这并不意味着存在两个主体，而是基于同一刑事责任根据单位成员在犯罪中的不同作用进行的处罚分担。这是一种对单位的犯罪行为进行全面、综合的处罚方式。

在此背景下，我国刑法第31条明确规定了对单位犯罪的处罚原则：对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员判处刑罚。但根据实际情况，在某些情况下如果犯罪的社会危害性主要反映在个人行为上，也可以只处罚个人。这就形成了我国刑法对单位犯罪以双罚制为主、单罚制为辅的处罚原则。这种灵活的处罚方式既能全面体现对单位犯罪的否定评价，也能根据具体情况做出合理、有效的处罚决定。