自然人B、C、D共同投资创建了A公司，为了代表公司内部职工股的股东行使权利，成立了职工持股会（简称持股会）。这个持股会并没有经过登记，其理事长为B，并已经向E出具了出资证明书。在出资证明书中明确指出，持股会的会员以他们的出资额（或所持股份）为限对持股会承担责任，而持股会则以其投入公司的出资额为限对公司承担责任。在持股会的章程中也有相同的规定。

近期，A公司的股东会作出了一些决策，其中涉及到的议题包括D将其在A公司的股份转让给B，以及将公司的“分布处理平台”和“网络管理平台”两个计算机软件的著作权无偿转让给其控股子公司F公司。对此，E作为持股会的会员，是否有权以A公司股东的身份提起诉讼，要求确认这些决议无效并要求C和B赔偿公司的损失呢？

根据我国公司法的规定，如果公司股东会或董事会的决议内容违反了法律或行政法规，那么该决议无效。如果股东会或董事会的会议召集程序、表决方式违反了法律、行政法规或公司章程，或者决议内容违反了公司章程，股东可以在决议作出之日起的六十日内请求人民法院撤销。如果公司的股东滥用权利给公司或其他股东带来损失，他们应该承担相应的赔偿责任。E要提出这样的诉求，前提是他必须具备A公司股东的身份，并且这些决议确实违法或侵害了公司和股东的合法权益。

关于E是否享有A公司的股东权的问题，虽然E持有持股会的出资证明书，但根据持股会的章程和规定，行使A公司股东权利的主体是持股会这一机构，而不是其会员个人。也就是说，E不能直接主张A公司的股东权利。持股会未经注册登记，并非我国法律规定的民事主体，且根据A公司的章程，持股会并不是A公司的股东。在A公司股东会作出决议时，只有登记的股东C和B享有权利。E作为持股会的会员并不享有A公司的股东权。

E并非A公司的合法股东，因此没有资格提起诉讼要求确认股东会决议无效或要求赔偿。即使B和C两位股东作出的决议存在争议，但因为其不违反法律规定和公司章程的议事规则，也不应被认定为无效或撤销。至于是否侵害了其他股东权益则需要具体情况具体分析。